A、大肠杆菌和酵母菌都含有细胞壁，A错误； B、大肠杆菌和酵母菌都含有细胞膜，B错误； C、大肠杆菌是原核生物，酵母菌是真核生物，两者最大的区别是有无核膜，C正确； D、大肠杆菌和酵母菌都含有核糖体，D错误． 故选：C．
