A、原子是由居于原子中心的带正电的原子核和核外带负电的电子构成的，原子核又是由质子和中子构成的，故A错；B、原子是构成物质的一种微粒，是化学变化中的最小粒子，故B错；C、原子在化学变化中不能再分，故C错；D、在化学反应中，分子分成原子，原子再重新组合成新的分子，所以原子是化学变化中的最小微粒．故选：D．
