两者差异不大，公务员编制是属于国家行政编制，享受国家财政拨款待遇；事业全供编制属于国家事业编制，也享受国家财政拨款待遇。两者的工资、福利待遇都差不多，区别在于行政编制人员的职责范围与事业编制的职责范围不同。如：省委宣传部部长，属公务员编制。他所管理的是有关政策导向、策划、宣传等工作；医院的医生则属事业编制，他只管行医治病。从中可以看出的是：公务员是管理国家公共事物的行政职权人，而事业单位的职工只管理本部门的事物。
