名侦探柯南 漫画 与黑组织有关的集数

001云霄飞车杀人事件（组织）
043江户川柯南诱拐事件(父母知道变小)
048~049外交官杀人事件(平次登场，第一次恢复)
054电玩公司杀人事件（组织）
057，058福尔摩斯迷杀人事件(平次知道身份)
128黑衣组织10亿元抢劫事件
129来自黑暗组织的女子大学教授杀人事件（组织）
170，171暗阁中的死角（新出登场）
176，177，178与黑暗组织的再会（组织）
188－－193危命的复活（新一，兰）
226，227格斗游戏的陷阱（朱蒂登场）
230，231谜一样的乘客（赤井登场）
258，259来自芝加哥的男子（詹姆斯登场）
269，270犯罪的纪念品（有提到警察局关于毛利的案卷被偷一事）
271，272紧急隐藏的省略（朱蒂）
277，278英语教师VS关西侦探（朱蒂）
284~285中华街雨中的似曾相识
286，287，288工藤新一NY事件（不用多说了吧）
307，308无声的证据（组织相关，下一集的引子）
309，310，311与黑色组织的接触（组织）
335，336东都显影所的秘密（有神秘人）
338，339 4辆保时捷（朱蒂和贝尔摩德假扮的新出发现哀）
340，341隐藏在厕所里的秘密（更多关于哀父母的消息，找到明美藏起来的录音带）
343，344便利店的陷阱（最后一段是小兰发现朱蒂藏的照片，怀疑朱蒂）
345与黑衣组织直面对决满月之夜的双重迷案（不多说了）
346，347寻找P股上的印记（上集案件的扫尾，关于哀拒绝证人保护计划的事）
385-387 斯特拉迪瓦里小提琴的不xx音
425 黑色的冲击！黑色组织魔爪伸来的瞬间(水无怜奈登场，小五郎受到怀疑，若不是秀一就挂掉了)
429--430无法回到从前的两个人(本堂)
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）
484 黑色照片的行踪（前篇）
485 黑色照片的行踪（后篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
507 卡拉OK房间的死角（前篇）
508 卡拉OK房间的死角（后篇）

1奇妙な人捜し杀人事件
[第2巻-File4「行方不明の男」
第2巻-File5「かわいそうな少女」
第2巻-File6「大男を追え！」
第2巻-File7「悪魔のような女]
2 新干线大爆破事件 (这个是有装扮很像黑色组织啦，本来不想打出来的，不过你有兴趣就可以看啦）
第4巻-File4「はちあわせた二人组」
第4巻-File5「グリーン车の四人」
第4巻-File6「ラスト10秒の恐怖」
3 黒の组织から来た女 大学教授杀人事件[1]
第18巻-File6「転校生は…」
第18巻-File7「黒ずくめの女」
第18巻-File8「コードネーム・シェリー」
4 黒の组织から来た女 大学教授杀人事件[2]
第18巻-File9「伪りの少女」
第18巻-File10「チェックメイト」
第19巻-File1「どうして…」
5 黒の组织との再会
第24巻-File7「裏切りの街角」
第24巻-File8「漆黒の葬列」
第24巻-File9「突然の别れ」
第24巻-File10「过去からの铳弾」
第24巻-File11「白の世界」
6 谜めいた乗客
第29巻-File3「见えない恐怖」
第29巻-File4「危険信号」
第29巻-File5「白日の下の潜伏」
7 黒の组织との接触 交渉编・追迹编・决死编
第37巻-File8「白い雪…黒い影…」
第37巻-File9「危険なめぐり逢い」
第37巻-File10「同乗者」
第38巻-File1「新兵器！」
8 黒の组织と真っ向胜负 満月の夜の二元ミステリー
第42巻-File5「満月の夜と黒い宴の罠」
第42巻-File6「血涂られた幽霊船」
第42巻-File7「透明人间现る!」
第42巻-File8「工藤新一登场!?」
第42巻-File9「仮面の下の真実」
第42巻-File10「ラットゥンアップル」
9 ブラックインパクト! 组织の手が届く瞬间
第48巻-File9「ピンポンダッシュ」
第48巻-File10「新たなる黒の者」
第49巻-File1「ターゲットを追え！」
第49巻-File2「新たなる指令」
第49巻-File3「黒の组织VS.FBI[1]」
第49巻-File4「黒の组织VS.FBI[2]」
10 黒の组织の影 谜の高额报酬・真珠の流れ星
第53巻-File10「不可思议なバイト」
第54巻-File1「夕食の献立」
第54巻-File2「梦见るスター」
11 赤と黒のクラッシュ 覚醒・搅乱・伪装・遗言・嫌疑
第58巻-File2「赤井の过去」
第58巻-File3「イチかバチか…」
第58巻-File4「拟装」
第58巻-File5「最终手段」
第58巻-File6「任务（ミッション）」
第58巻-File7「姉弟」
12 赤と黒のクラッシュ 嫌疑・洁白・决死・殉职
第58巻-File8「意外な容疑者」
第58巻-File9「13日の金曜日」
第58巻-File10「キャメルの过去」
第58巻-File11「魔法の呪文」
第59巻-File1「钢の楔」
P.S:看不懂日文不要紧，上面有第几卷第几卷的

漫画版
01/01 001 现代的福尔摩斯
01/02 002 变成小孩子的名侦探
12/04 114 突如其来的遭遇
12/05 115 炸弹的下落
12/06 116 柯南失算了
18/06 176 转学生
18/07 177 黑衣女郎
18/08 178 秘密组织成员·
18/09 179 伪装的少女
18/10 180 将死
19/01 181 为什么？
19/09 189 被狙击的球！
19/10 190 5万6千名人质
20/01 191 远方之眼
24/07 238 背叛的街角
24/08 239 漆黑的丧葬行列
24/09 240 不告而别
24/10 241 来自过去的子弹
24/11 242 白色世界
29/03 287 看不见的恐怖
29/04 288 危险讯号
29/05 289 光天化日下的埋
34/11 350 金苹果（1）
35/01 351 金苹果（2）
35/02 352 金苹果（3）
35/03 353 金苹果（4）
35/04 354 金苹果（5）
37/05 377 黑暗的足迹（1）
37/06 378 黑暗的足迹（2）
37/07 379 黑暗的足迹（3）
37/08 380 白雪…黑影…
37/09 381 危险的相遇
37/10 382 顺风车
38/01 383 新兵器！
41/10 423 到访者留下的谜
41/11 424 小小密室的秘密
42/01 425 隐藏的真相
42/05 429 月圆之夜和黑宴
42/06 430 染血的幽灵船
42/07 431 隐形人出现
42/08 432 工藤新一登场
42/09 433 面具下的真相
42/10 434 腐坏的苹果
48/09 499 门铃怪客
48/10 500 新的黑衣组织成员
49/01 501 追踪目标！
49/02 502 新的指令！
49/03 503 黑衣组织vsFBI
49/04 504 黑衣组织vsFBI
53/07 550 目击者一人
53/08 551 钉子与蛇
53/09 552 锤子的真面目
53/10 553 不可思议的兼职
54/01 554 晚餐的菜单
54/02 555 梦中之星

参考：百度百科

漫画版
01/01 001 现代的福尔摩斯
01/02 002 变成小孩子的名侦探
12/04 114 突如其来的遭遇
12/05 115 炸弹的下落
12/06 116 柯南失算了
18/06 176 转学生
18/07 177 黑衣女郎
18/08 178 秘密组织成员·
18/09 179 伪装的少女
18/10 180 将死
19/01 181 为什么？
19/09 189 被狙击的球！
19/10 190 5万6千名人质
20/01 191 远方之眼
24/07 238 背叛的街角
24/08 239 漆黑的丧葬行列
24/09 240 不告而别
24/10 241 来自过去的子弹
24/11 242 白色世界
29/03 287 看不见的恐怖
29/04 288 危险讯号
29/05 289 光天化日下的埋
34/11 350 金苹果（1）
35/01 351 金苹果（2）
35/02 352 金苹果（3）
35/03 353 金苹果（4）
35/04 354 金苹果（5）
37/05 377 黑暗的足迹（1）
37/06 378 黑暗的足迹（2）
37/07 379 黑暗的足迹（3）
37/08 380 白雪…黑影…
37/09 381 危险的相遇
37/10 382 顺风车
38/01 383 新兵器！
41/10 423 到访者留下的谜
41/11 424 小小密室的秘密
42/01 425 隐藏的真相
42/05 429 月圆之夜和黑宴
42/06 430 染血的幽灵船
42/07 431 隐形人出现
42/08 432 工藤新一登场
42/09 433 面具下的真相
42/10 434 腐坏的苹果
48/09 499 门铃怪客
48/10 500 新的黑衣组织成员
49/01 501 追踪目标！
49/02 502 新的指令！
49/03 503 黑衣组织vsFBI
49/04 504 黑衣组织vsFBI
53/07 550 目击者一人
53/08 551 钉子与蛇
53/09 552 锤子的真面目
53/10 553 不可思议的兼职
54/01 554 晚餐的菜单
54/02 555 梦中之星

主线（黑暗组织登场）
600-609（属于 红与黑的碰撞 后半段）
619-621 本堂瑛佑离开
622-624 冲矢昂登场
638-640 柯南冲矢昂 推理对决
664-666 侦探团和冲矢昂 比目鱼的推理

其它与主线有关的特别篇：
631-634 基德的瞬间移动
646-654 柯南暂时恢复为新一