可以按照正常程序离职。但从防范风险的角度出发，应当按公司法相关规定，到工商部门办理法定代表人变更手续。
法人代表由股东委派，看你们章程对委派又没有具体规定，如任期年限、委派是股东一致还是占投资额多大比例大股东委派？你可以在股东开会时提出辞职，同时作为大股东同意自己辞职。或者在任期届满时不再接受委派都可以。但如果因公司存在问题不愿做法人代表，那你作为大股东对公司失去控制，风险可能更大。
法人代表已经就是公司股东，虽然你只是名义上的，但法律上是有效的，必须到工商部门更正注册。
最好不要辞职，损失会很大的
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