自建校以来，学校先后隶属于东北行政委员会农业部、国家高等教育部、国家农业部、黑龙江省农业委员会、黑龙江省教育厅，1981年被确定为黑龙江省省属重点院校，1994年与黑龙江省农业管理干部学院合并组建东北农业大学，现为国家“211工程”重点建设大学，黑龙江省人民政府与农业部省部共建大学。
