A、叶绿体合成的ATP被暗反应在叶绿体基质中应用，不能通过核孔进入细胞核，A错误；B、离子（H+）带有电荷，不能自由穿过液泡膜，H+进入液泡，是通过液泡膜上的V型质子泵转运的，B错误；C、溶酶体内的酶可以消化细胞内的衰老、损伤的细胞器，C错误；D、内质网内与核膜相连，外与细胞膜相连，内质网的膜结构成分可以通过高尔基体转移到细胞膜中，D正确．故选：D．
