肥西县广为第四系土壤堆积物覆盖，仅在中西部部分有较多基岩出露，面积约300平方公里。全境大部分为中新生代陆相地层。县境西北高，东南低。中北部属江淮丘陵，江淮分水岭自西向东北横穿而过，中西部有一系列低山，低山绵延25千米，大潜山海拔289米，为全县最高点。地形起伏多变，岗冲相间，落差较大。东南为巢湖盆地，湖河沿岸有狭长的冲积平原。
