虽然质子重离子治疗为癌症患者带来了新的希望，但是质子重离子治疗并不能治疗所有的癌症。临床治疗结果显示，质子重离子治疗技术对于非小细胞肺癌、前列腺癌、肝细胞肝癌、头颈部肿瘤、中枢神经系统肿瘤等癌症治疗的效果较好，且副作用较小，预后效果较好。
但是，质子重离子治疗技术并不适用于一些全身性的恶性疾病、空腔脏器癌症以及发生远处转移的癌症。因此，癌症患者在接受质子重离子治疗前，应由专业医生进行判定。
