你好，l want you to be my friend.这句话里面有一个固定搭配就是
want sb to do something或者want sb to be
也就是说to 后面要跟动词原形
例如，
I want to be the best one 我想成为最优秀的人。
而这句话里面我想成为你的朋友，就是同样的道理。
基于后面跟原形，只能用be
因此I want to be your friend 是正确的
谢谢提问，望采纳！
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