说拜占庭帝国的衰落源自查士丁尼本人“好大喜功”，是曾经的拜占庭史学界比较常用的说法（比如全球通史）。但如今一般认为拜占庭帝国衰落的原因和查士丁尼西征服没有什么太大关系。国内学界从意识形态上批判查士丁尼反动的历史观差不多八十年代中后就开始弱了，现在人们更多的认为帝国衰落的原因是查士丁尼大瘟疫。这次瘟疫是欧洲历史上最大的两次瘟疫之一，另一次就是所有人都听说过的中世纪晚期鼠疫大爆发。这次瘟疫根据记载症状来看是一次腺鼠疫爆发。其实这次瘟疫对整个欧洲乃至波斯都有打击，但是拜占庭比较倒霉，瘟疫的传播是从埃塞俄比亚进入埃及，然后从埃及传播到整个帝国，再是西欧和波斯。可以说拜占庭是挡下了瘟疫的最凶猛第一波。而且当时就属拜占庭人口稠密，货币经济发达，城市化程度高，所以受到的打击也就最惨重，瘟疫导致的是整个国家经济链条的崩溃（帝国财政收入超过一千万诺米斯马金币，瘟疫以后三百多年里都没有能恢复到六百万诺米斯马以上）。帝国人口三千多万，瘟疫后死掉了超过一千万，首都人口百万，瘟疫后不足五十万。
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