测序深度的深度指的是什么

深度测序技术的深度不理解,有哪位高手帮忙解答一下
2024-11-19 01:34:02
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回答1:

测序深度(Sequencing Depth):测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小(Genome)的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。重测序的个体,如果采用的是双末端或Mate-Pair方案,当测序深度在10~15X以上时,基因组覆盖度和测序错误率控制均得以保证。

回答2:

测序深度是测序量除以基因组长度,例如测序深度10*就相当于测了10次的全基因组