虹口区内有轨道交通3号、4号、8号、10号、12号线经过，内环、中环穿越区内，交通便捷。
除了轨道交通外，上海市将打造“北横”通道，连接虹桥综合交通枢纽与市内各区。“北横”通道西起虹桥综合交通枢纽，沿长宁路、长寿路、天目西路、海宁路、周家嘴路至军工路，在与其相交的重要道路处采用立交化解决方案，虹口范围涉及河南北路、吴淞路、大连路三处立交（下立交，地道）。
上海制定了井字型通道规划建设方案。井字型通道位于虹口区内的主要通道包括：外滩通道、新建路隧道、南北通道以及三横北线周家嘴路 - 海宁路。
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