食用百合等在种植前和生长都需要对土壤进行消毒杀菌，以防土壤中的病原微生物对百合造成危害。
做土壤消毒的产品比较多，大致可以分为气体、固体粉剂和液体类型的，按照与土壤接触良好程度来看：液体>固体>气体。腐霉菌等微生物是比较顽固的，一般杀菌方式很难将其彻底杀灭和控制，这也是土壤消毒难做的原因之一。
目前土壤消毒最好的方式是水溶性液体杀菌剂，与水完全混合后渗入土壤至少20-30公分，将土壤中的致病微生物杀灭，推荐使用欧盟方面的产品，生态型较好，没有毒性和残留，例如德国Oxytech等品牌。国内产品基本都是国外产品在专利过期后仿制的，很少有自己的核心技术，希望以后国产产品能够拥有产品研发和核心技术。
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