A.淀粉和纤维素的分子式为(C6H10O5)n,但n不同,即分子式不同,所以不是同分异构体,故A错误; B.蔗糖和麦芽糖的分子式相同,都为C12H22O11,二者的结构不同,属于同分异构体,故B正确;C.正丁烷和异丁烷分子式相同,结构不同,互为同分异构体,故C正确;D.果糖和葡萄糖分子式相同,结构不同,互为同分异构体,故D正确.故选A.