1、水系沉积物测量一般在小比例尺调查时使用。因此要求以个样品代表相当大面积内元素的平均含量。2、取样时要选择河流中最年轻的活动物质，要尽量避开不能代表整个汇水盆地的采样点。3、对所选指示元素要进行富集粒度试验，保证全区样品属于同一粒级。4、水系沉积采样要尽量采集细砂、粉砂、淤泥，避免粗粒岩屑或砂子。5、取样时间以雨季后期采样最为有利，对于四季雨量变化不明显地区，则无时间限制。
