按规定，必须是在开票当月月底之前、而且是必须所有联次收回，才允许作废发票的。否则属于违规作废，税务机关可按发票管理办法的规定进行处罚。 相信您这种情况应该是在电脑上误点了作废。
详细处理办法如下： 一、对方已将发票认证，信息已上传，无法删除，而你们却误作废，稽核系统将出现比对不符，总局将肯定会通过《增值税抵扣凭证审核检查管理系统》下发核查信息给购货方的主管税务机关核实原因的。 二、因为纳税义务已发生，销售方应将误作废发票相关的收入，作为“未开票收入”如实申报交税！
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