从你说的看，你的每组数据中也就是只有4-5个案例数据，也就是案例数量太少了，在采用lsd进行多重比较的时候，是很容易会出现一些矛盾的结论的，这是一个原因，另外lsd进行多重比较本身也可能会出现一些矛盾现象，这也就是为什么会出现方差分析来代替两两多组重复进行均值比较的原因，而lsd也正是基于两两检验的结果，容易犯a或者β错误。
这个没有办法解决，在这种情况下，如果遵照数据事实的话，你可以在结果描述的时候这样写“由于数据量的问题，导致多重比较结果出现矛盾现象，可能需要进一步加大数据量进行验证”。也可以不采用lsd换其他的多重比较方法进行尝试。
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