最主要的原因是，非洲的热带气候使其成为一个热区，简而言之，非洲大陆是新兴病原体的温床。除此之外，科学家认为环境的剧烈变化，例如全球变暖和热带雨林的破坏，和非洲地区人口的快速增长和杂乱无章的发展促使了微生物快速繁衍的后果。最终可以发现自1970年代中期以来，全世界已经发现了30种新的传染病以及疟疾和霍乱等病毒的复现，并且其中许多起源于非洲大陆。
在过去十几年中，全球变暖带来的洪水和干旱加剧了这种情况，极端天气创造了有利于传染病暴发的条件。 例如，大雨为携带疟疾，登革热和其他疾病，同时污染饮用水的蚊子提供了新的繁殖场所。另一方面，干旱会引发火灾，进而引发呼吸系统疾病，甚至是脑膜炎。但当疾病袭击非洲时，贫穷，营养不良，拥挤的生活条件，有限的医疗保健和不稳定的基础设施将使疾病肆无忌地传播。
病毒潜伏在动物中，但是人类通过破坏自然，将它们释放了出来。例如，对热带雨林的破坏可能部分导致了成群的疫情暴发-从狂热的疟疾到出血性埃博拉病毒。当砍伐树木时，森林中会暴露出大量受感染的水。我们所做的是为可能携带疟疾等疾病的蚊子建立新的繁殖地。当人们穿过森林寻找木柴时，他们可能会暴露于这种病毒中，而这种病毒本来可以被相对遏制的。
破坏热带雨林还导致保护人类免受传染病侵害的野生动植物遭受打击。例如，人类捕杀土狼，蛇和其他捕杀携带疾病的啮齿动物和蚊子的捕食者，以寻找更多的木材或食物。因此，我们抵抗类似鼠疫和疟疾等病毒的天然缓冲区——它们的天敌也就受到了破坏。养有鸟类的茂密森林和养有鱼类的湖泊对控制蚊子的数量很重要，这在一定程度上可以解释黄热病和疟疾等疾病的复发。有时人类的举止可能诱发新的病毒，虽然非洲尚未发生这种情况，但如果不采取措施保护环境，后果将不堪设想。
非洲消耗大量丛林肉，这些肉来自未驯服的哺乳动物、爬行动物、两栖动物和鸟类，经常在热带森林中被猎杀作为食物。捕获和交易丛林肉不仅对生物多样性构成威胁，还为一些严重的热带疾病从动物宿主传播到人类提供了途径，如艾滋病毒和埃博拉病毒。
20世纪90年代，埃博拉在刚果盆地和加蓬的爆发与猿类屠杀和猿肉消费有关。同样，人类免疫缺陷病毒目前存在于现代黑猩猩中。已经证实，它是从红顶蟒蛇和大斑点犀牛中存在的旧病毒株中突变和分离出来的。艾滋病毒最初可能是在接触受感染的丛林肉后传染给人类的。西非和中非丛林肉的贸易量估计为每年300万至500万吨。对这些地区的人们来说，丛林肉是饮食中动物蛋白的主要来源，使其成为一个重要的产业。该研究发现，当地市场上出售的肉类中有一半以上是丛林肉，灵长类动物占丛林肉总量的20%。
虽然非法，但濒危物种，包括马达加斯加狐猴和猿，经常被猎杀作为丛林肉。然而，丛林肉的动物来源可能携带各种人畜共患疾病的病原体，如天花、水痘、肺结核、麻疹、风疹、狂犬病、黄热病和雅西病。在许多情况下，猎人在切肉过程中经常与动物血液和其他液体密切接触，从而被感染。另一种感染方式是一些肉可能没有完全煮熟就被吃掉。
另一个原因是，非洲主要由不发达的第三世界国家组成，那里的医疗条件极其差，没有办法防止病毒的传播。在发达国家，传染病通常可以通过隔离和疫苗生产来预防。然而，非洲的公共卫生基础设施最薄弱，在非洲建立有效的公共卫生基础设施和提供与传染病有关的合格专业人员至少需要几年到几十年的时间。非洲新传染病监测、研究和培训的基础设施和支持水平极其有限。在非洲，受过培训的传染病专家人数正在减少，从社区卫生工作者到实验室技术员，再到病毒学、微生物学、医学昆虫学、流行病学和公共卫生方面的专业人员。
非洲是一个落后的大陆，大陆主要以热带沙漠、热带雨林以及热带草原气候为主，人们对自然破坏比较凶，科学、医疗意识非常低。
因为热带气候。非洲是热带气候国家，为病毒提供了有力的生活条件。又因为非洲杂乱无章的发展，也导致了病毒快速发展变异
病毒的生长繁殖也是需要条件的，非洲的温度相对于其它地方较高，另外一方面，非洲地区经济比较落后，人们生活水平低下，那样的环境也为病毒的滋生铺上了温床。
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