软件著作权登记证书有以下作用：
1、软件著作权登记证书能够起到向外公布登记事项的作用；
2、软件著作权登记证书能够对产生软件著作权的案件起到相应的证据作用。
【法律依据】
《计算机软件保护条例》第六条
本条例对软件著作权的保护不延及开发软件所用的思想、处理过程、操作方法或者数学概念等。
第七条
软件著作权人可以向国务院著作权行政管理部门认定的软件登记机构办理登记。软件登记机构发放的登记证明文件是登记事项的初步证明。
办理软件登记应当缴纳费用。软件登记的收费标准由国务院著作权行政管理部门会同国务院价格主管部门规定。
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