就业协议只是你和用人单位之间的协议,说明单位要你,你也想去这个单位。只在你和单位之间有效。协议一般都要求一定期限内签订三方协议(也就是你说的学校发的毕业生就业协议书)
只要是公平公正的,在法律范围内允许的,都有效