正确的处理方式是：可将专用发票抵扣联作为记账凭证，专用发票抵扣联复印件留存备查。文件依据：《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第三十一条《国家税务总局关于简化增值税发票领用和使用程序有关问题的公告》（国家税务总局公告2014年第19号）第三条
一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前已认证相符的
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