通常用两性霉素B (Fungizone)
两性霉素B是一种对真菌有抗菌活性的抗生素。将其作为一种抗真菌、抗酵母菌以及抗霉菌制剂使用。它通过与固醇结合，干扰敏感真菌的细胞膜渗透性。通常的有效浓度是2.5μg/ml，在30μg/ml时有细胞毒性。
此外也可以选择在培养基里加3u/ml的制霉菌素或放线菌素D。
真菌污染是个很麻烦的事，很难彻底消除，建议重新复苏细胞或从新分离或购买细胞。
在细胞培养中未见有用灰黄霉素的，用法与用量不详。
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