我国传统医学也主张天人合一，强调人与自然的和谐。《黄帝内经》继承了《周易》天人合一的整体观把人体看成是自然界的一部分。因而在观察人体的生理病理变化时，主张不能仅仅孤立地着眼于人的肌体本身，而应看到人与自然界存在着的有机联系。《黄帝内经》说：“夫道者，上知天文，下知地理，中知人事。”(《素问·气交变大论》)也就是说，只有像《周易》所阐明的把天道、地道、人道相互结合起来，进行综合观察，才能正确地把握医道。由于《黄帝内经》体现了天人合一的整体观，因而特别强调天时物候的变化对人体生理病理的影响，并一再指出，要想正确把握人体病情的变化，必须首先做到“因天之序，盛虚之时，移光定位，正立而待之。”(《素问·八正神明论》)把正确掌握日月星辰、季节气候的变化，看作是正确把握人体生理病变的前提条件。中国传统医学中的天人合一思想，是在长期的医疗实践中，认识到人的肌体与天时气候的变化密切相关。天时气候的反常和交互影响，会引起人的肌体的适应性的变化，因而常会因此引起各种病变。这种变化乍看起来难以捉摸，但又是有规律可循的。这是中国传统医学中朴素的唯物论观点和自发的辩证法思想。它使中国传统医学一开始就避免了那种头疼医头、脚痛医脚的片面的机械的方法。《黄帝内经》强调用的“候日月、星辰、四时、八正”来考察人体生理病理的方法，奠定了中国古代医疗气象学的基础，作为指导临床辨症论治的重要参考依据，体现了中国传统医学“法天则地，合以天光”的独特风格。西汉严君平著《老子指归》中还详细地阐述了天人合一的基础。他说：“由此观之，天地人物，皆同元始，共一宗祖，六合之内，宇宙之表，连属一体，气化分离，纵横上下，剖而为二，判而为五。或为白黑，或为水火，或为酸碱，或为徵羽，人物同类，或为牝牡。”“人主动于迩，则人物应于远。人物动于此，则天地应于彼。彼我相应，出入无门，往来无户，天地之间，虚廓之中，辽远广大，物类相应，不失毫厘者，同体故也。”道教对“天人合一”的认识非常深奥，这里不多赘述，简单地说，道教的“天人合一”讲究的是人是自然的一个部分，人应返璞归真，顺其自然。
(3)儒家学说的天人合一理论
儒家强调“天道”与“人道”或“自然”与“人为”的合一。战国时由子思、孟子提出“天人合一”理论。此后，儒家的一代代弟子们便从“理”、“性”、“命”等方面来论证。儒家“天人合一”观念，其本义并非直接讨论人与自然的关系。
在认识论上，儒家以“主客二分”为前提强调“天人合德”的价值观，讲究人对于自然万物在精神价值上的统一，以“兼爱”来解决人与自然的对立，在承认人与自然差别的基础上，把人类之爱推之于自然万物，从而以博爱主义将人道主义与自然主义统一起来。如《礼记》提出：“天命之谓性，率性之谓道，修道之谓教。”道本于天，修道为教化，天命、道德、教化相通。又谓“礼也者，合于天时，设于地财，顺于鬼神，合于人心，理万物者也。”天地神人合一而成“礼”。《中庸》所讲的“唯天下之至诚，为能尽其性；能尽其性，则能尽人之性；能尽人之性，则能尽物之性；能尽物之性，则可以赞天地之化育；可以赞天地之化育，则可以与天地参矣。”也即在价值上实现人与天、地的三者合一。
对人体的健康与养生而言，儒家的“天人合一”观，一是要注重人改变事物发展的能动性；二是要注重人的精神价值，以“仁”、“博爱”取得内外的和谐，表现了法天与顺民、明道与事功、心性与性理、仁政与理义等复杂的协调关系。
(4)马克思主义学说中的天人合一理论
马克思主义理论不排斥“天人合一”观念。在理解马克思关于人类与自然界的关系时，有一种片面的观念一直影响我们正确地理解，这种观点就是：“人类是大自然的主人。”这是片面地扩大人作为自然存在物的地位和能力，对人类所具有的能动性和创造力进行妄自尊大的理解。这不是马克思主义的原意，近年来来自自然界对人类的巨大影响也证明：我们不可能完全掌握和控制大自然。辩证唯物主义的一个最基本的观点就是“事物是普遍联系的”。历史唯物主义认为，人具有双重属性，即：人的自然属性与人的社会属性。作为个体的人是自然存在物，它与自然界的关系应具有能动性与规律性的统一。既不能夸大人的能动能力，也不能夸大人在大自然面前的软弱无力。在论述共产主义时，马克思主义的创始人给我们指出：“这种共产主义，作为完成了的自然主义，等于人道主义，而作为完成的人道主义，等于自然主义，它是人和自然界之间、人和人之间的矛盾的真正解决，是存在和本质、对象化和自我表现确证、自由和必然、个体和类之间的斗争的真正解决，它是历史之谜的解答，而且知道自己就是这种解答。”(《马克思恩格斯全集》第42卷，第120页)运用马克思主义的辩证唯物主义和历史唯物主义的方法理解，我们不难看到，这里说的“人类和自然界的矛盾的解决”，就是到了共产主义，自然界已不再是人类的一种异己力量。而自然界对人类来说，则如恩格斯所说的，自然界已通过人类实现了“自我意识”，从而实现了“自我改造”；而从人类来看自然界，人类对自身的认识和改造已经到达了与自然浑然一体的程度，就是说，人类的自身自然和对象自然都与人类的本性融为一体了。也就是说，马克思主义的创始人给我们描述的共产主义，人与自然是和谐的统一体。仅以此理解，马克思主义理论并不排斥“天人合一”观。
除此以外，如果从系统论和控制论等现代哲学理论的观点理解，人类作为自然界大系统中的一个环节，作为自然控制的一个动力，“天人合一”的观念对客观理解和认识我们自身，达到人与自然科学合理的统一，都将有着积极的意义。
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