有些细菌在生长发育后期,个体缩小、细胞壁增厚,形成芽孢.芽孢是细菌的休眠体,对不良环境有较强的抵抗能力.有的细菌外面有荚膜,较厚,有保护作用,有的还有鞭毛,可以摆动,有鞭毛的细菌可以运动.因此细菌的特殊结构是荚膜、鞭毛、芽孢.故选:D.