高粱的病害主要有黑穗病和真菌性叶斑病，其次是细菌性叶斑病、病毒病。 为害高粱的病害还有细菌性叶斑病：条纹病Pseudomonas andropogoni、斑点病Pseudomonas syringae。病害性的矮花叶病(scMV)。真菌侵染的纹枯病Pellicularia spp.、麦角病Claviceps sp.等。这些病害发生不普遍，为害轻，对生产影响甚微。
