这是个宾语从句,从句里的助动词did要省略,动词用原有的时态,即went.即宾语从句后用陈述句。所以Tell me where you went?正确
Tell me where you went,作陈述句
两句都不好语气委婉比较好:Could you tell me where you went?
这应该是陈述句,第二句正确,改为句号
这是祈使句,直接说就好。tell me where you went