(1)京九铁路从北京到终点九龙,途中唯一经过的省会城市是江西省的南昌.(2)将新疆的长绒棉从乌鲁木齐运到上海,经过最近的铁路线依次是:兰新线、陇海线、京沪线.(3)京广线与浙赣线相交于株洲,兰新线与包兰线相交于兰州,京沪线与陇海线相交于徐州,京广线与陇海线相交于郑州.故答案为:(1)九龙;南昌;(2)兰新线;陇海线;京沪线;(3)