从停薪留职之字面上来理解，你现在是停薪并没有说停社会保险，所以说，社会保险该怎么交还应该继续怎么交--单位的部分单位交，个人的部分个人交。在实践中，停薪留职的，也多是由单位继续承担社会保险的缴纳的。另外，确实还要尊重你和单位达成的停薪留职协议的内容。如果协议中约定了在停薪留职期间，保险由个人交纳，那这个协议的内容对双方有约束力，单位可以据此停交保险。如果没有约定，则仍应该由单位承担应该承担的部分。
