反义敲除,是相对于敲除（knock out）来说的.
后者,是指基因的完全失活,包括我们常说的插入突变,点突变（如果完全影响了蛋白功能）,无义突变,移码突变等等.也就是说在knock out的个体中,目的蛋白是不表达或者没有活性的.
knock down,RNAi界导的knock down,其原理是,用各种方法产生编码目的蛋白的mRNA的互补RNA,比如很早的anti-sense RNA,以及现在比较多的RNAi.我只了解一点皮毛 我印象中,这种反义敲除只能部分地降低目的基因的功能,很难达到完全的knock out.所以也有人说是knock down.当然不同基因,效果肯定也是不一样的.
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