单位不配合申请一次性医疗补助金 能直接告上法院吗?

可以向当地的劳动监察大队投诉，或者可以申请劳动仲裁。
医疗保险报销。
办理材料：
1. 病历；
2. 检查、化验报告单；
3. 出院小结；
4. 出院证明；
5. 费用明细；
6. 财政监制章的正规票据；
7. 医保卡。
住院报销流程
参保人出院时，参保人住院自费和自负部分金额及统筹基金报销金额由医院与区医保中心结算。
门诊报销流程
在一个自然年度内，参保人看病累计超过起付标准，参保人将相关单据交到单位或医疗保险管理中心，单位或医疗保险将材料提交到医保中心。医保中心在15个工作日内即可完成结算，支付工作。
门诊特殊病报销流程
参保人将相关单据交由单位或社保所，单位将单据提交到医保中心。医保中心当日即可完成审核、结算、支付。

本人2012年1月9日与公司签订为期三年的劳动合同从事店长工作，2013年5月20日本人因腰椎间盘突出症及脊柱炎入院接受腰椎间盘摘除丶椎间植骨融合丶钉棒系统内固定术。(本人医疗期为六个月。) 2013年11月19日医疗期满后，因身体原因医生继续让本人休息并开具诊断书(1个月)及病历(要求静养戴腰围保护下活动)。本人与单位沟通，申请延长医疗期被公司拒绝。公司人事11月22丶25曰发邮件协商与本人解除合同，被本人拒绝，本人要求做劳动能力鉴定被公司漠视，公司于2013年11月26日发出调岗通知，因本人身体情况无法从事店长工作，将本人调整到员工岗于2013年12月2日到岗或11月29日前将意见反馈给公司。我告知公司无法正常到岗，要求公司给我做劳动能力鉴定。结果公司于2013年12月6日将一份劳动合同解除通知书快递给本人，公司单方面解除合同了。我于2013年12月9日到仲裁申请，请求公司支付本人6个月医疗补助金。在2014年1月10仲裁开庭双方陈述后，法官口头询问本人及公司是否做劳动能力鉴定？ 本人答复：本人去大连劳动能力鉴定中心申请鉴定时，被告之只接受工伤鉴定和企业委托的劳动能力鉴定，不针对因患病的情况下的个人做鉴定。 公司答复：没用去劳动能力鉴定中心给本人做过鉴定。 开庭当日

不能可以去仲裁