两个相互作用的蛋白用SDS-PAGE电泳时会被分开的，如果分子量差距大的话就是两条带，如果分子量差距很小，考虑到胶分辨率的问题可能会是一条带。原因就是因为SDS会破坏蛋白的高级结构，结构决定功能，不具备高级结构的蛋白也就不能发生相互作用。而SDS PAGE是根据蛋白质的分子量来分离蛋白的。所以说会被分开的
