前景还可以，互联网对其影响很大，据《互联网对中国功能食品行业的机遇挑战与应对策略专项咨询报告》显示，随着慢性疾病预防纳入国家“十二五”目标规划。这表明国家对功能性食品的支持力度不断增大，功能性食品将会迎来黄金发展期。
截至目前，我国保健(功能)食品有14000多个，其中近90%为第二代产品，功能因子的构效关系、量效关系、作用机理不清楚,低水平重复现象严重。同时，国内功能性食品生产地发展不均衡，在北京、上海、广州、天津几大城市占50%左右，而西北、西南地区仅占5%，第三代功能性食品又甚少。
面对国内功能性食品生产地发展不均衡现象，促进功能性食品产业结构的调整和优化升级势在必行，这就需要向科技借力，通过科学的规划，进一步优化产业布局。
未来几年，针对功能性食品的研发侧重点，从技术角度看，围绕新功能、新原料展开;从功能研究方向看，着重研究功能食品的构效关系、量效关系、作用机理、生物利用率和功能效应。
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