南京军区主要有以下几所军校：
1.中国人民解放军理工大学
2.解放军国际关系学院
3.南京政治学院
4.南京陆军指挥学院
5.南京炮兵学院
6.工程兵工程学院
7.空军气象学院
中国人民解放军陆军工程大学 （The Army Engineering University of PLA）是2017年以解放军理工大学和军械工程学院主体为基础组建，是人才培养与科学研究并重、工程技术与作战指挥融合的教学研究型综合性大学。
中国人民解放军国际关系学院，简称解放军国际关系学院，又称南京解放军国际关系学院，始建于1951年6月，位于江苏省南京市。该校是一所全国重点高等军事院校，隶属中国人民解放军总参谋部，正军级，主要培养国际战略、军事外交、外语专业人才。
中国人民解放军南京政治学院（简称：南京政治学院），是隶属总政治部领导的中级任职教育院校，编制等级为正军级，是军队“2110工程”重点建设院校和全军研究生培养单位重点建设院校。
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