电子发票与传统发票的区别主要有两点：一是从传统的物理介质发展为数据电文形式，二是打破了纸质发票作为会计记账凭证的传统，可以作为会计档案电子记账形式进行保存。
电子发票是影印件，消费者要根据需要决定是否打印，打印时对纸张没有过多限制，作用等同于纸质发票，可用于报销、售后等，但目前只能开普通发票，不能开专用发票，即不能用于抵扣进项税。
纸质发票是税局统一印制标准格式的空白，由销售货方在开票系统开票后打印在纸质发票上，需要加盖发票专用章并交付给购买方，可以是普通发票，也可以是专用发票。既可以用发报销、售后，专业发票还可以用于抵扣进项税。
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