毕业证书是一样的，按照合肥工业大学学籍管理规定等有关要求，符合毕业条件的颁发同一合肥工业大学本科学历证书，达到学位授予条件的颁发同一学士学位证书。
宣城校区是合肥工业大学的重要组成部分，学校对宣城校区实行一体化管理。宣城校区依托合肥工业大学学科优势，面向地方经济社会发展需求，高起点、高标准、高质量地进行宣城校区专业建设，依托学校现有的办学优势，以建设适应地方经济社会发展需要的专业为起点，
逐渐形成与合肥两个校区互为依托的专业布局。学校负责规划筹建、学科建设、专业设置、教学组织、师资队伍、学生管理、质量监督、招生就业等，保证教学计划的实施和学生培养质量。学校组织精干、高水平的教师队伍落地宣城，作为宣城校区教学的中坚力量。
宣城校区目前设有机械工程系、材料工程系、计算机与信息系、电气与自动化系、能源化工系、城市建设工程系、生态环境系、物流管理系、经济与贸易系、文法系、英语系、食品科学系等12个系，1个基础部，共30多个本科专业，不断加强学科专业建设，实现与合肥校区差异化发展。
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