1、参加自主招生的院校基本上是面向全国各省份考生,只有部分院校面向本省份考生。而综合评价招生制度只是部分省份实行的综合评价模式,不是全国所有省份考生都可以参加的。2、通过自主招生面试及笔试的考生是按照高考成绩录取的,但有分数不等的优惠录取政策。而综合评价招生是把考生的综合素质评价、高校的自测评估成绩、高考成绩按照一定比例折算成综合分,最后按照综合分择优录取的方式。