有区别。业务范围上，长江海事局负责长江干线水域的水上交通安全监管。沿长江的地方局负责长江支流水域、省（市）行政区内其他内河通航水域的水上交通安全监管。行政上，长江海事局由交通运输部长江航务管理局管理。地方局由省（市、区）交通运输厅（委员会）管理。机构属性方面，长江海事局是行政机关。多数地方海事局是事业单位，有的参照公务员法管理。
