研究所共21所。
医学系
物理治疗学系暨研究所
护理学系暨研究所
中医学系
医学生物技术暨检验学系
呼吸照护学系
职能治疗学系
生命科学系
医学影像暨放射科学系
基础医学研究所
微生物及免疫学科
解剖学科
公卫暨寄生虫学科
生化暨分子生物学科
生理暨药理学科
临床医学研究所
医学生物技术研究所
天然药物研究所
复健科学研究所
护理学研究所
临床行为科学研究所
传统中国医学研究所
颅颜口腔医学研究所
工学院
电机工程学系/研究所
机械工程学系/研究所
化工与材料工程学系/研究所
电子工程学系/研究所
资讯工程学系/研究所
光电工程研究所
生化与生医工程研究所
医疗机电工程研究所
管理学院
医务管理学系/研究所
资讯管理学系/研究所
工业设计学系/研究所
工商管理学系
企业管理研究所/EMBA
通识教育中心
教育学程中心
校舍与校地
现有校地37.13公顷，现有校舍包括第一医学大楼、工学大楼、管理大楼、第二医学大楼、学生宿舍（三栋）、学生活动中心、图书馆等九栋，总建筑面积共412,235平方米。每位学生平均校地面积50.1平方米，平均校舍面积55.7平方米
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