首先 农村户口和城镇户口都可以办理养老保险，只不过是看你办理哪一种，如果是办理职工保险的话就是五险一金那种， 那种是城镇和农村都可以的， 新农保是农民特有的
按你的说法，你交纳的应该是 五险一金那种， 农村和城镇的区别就在于 城镇户口交纳11%（养老8%+医疗2%+失业1%） 农村户口的 交10%（养老8%+医疗2%）
其次，就算是合资公司 也好给与交保险， 个人档案到不是非得需要，你可以问问你们公司办理这个的， 这个档案跟大学毕业的档案不是一回事， 可能是职工档案，你可以按照新参保人员办理， 大学毕业的档案是人事档案， 现在交保险已经不和人事档案挂钩了
第三 农村户口也能买住房公积金 比例也是 个人单位各50%
不过住房公积金 很多单位都不交的， 看你们单位什么个态度了
档案一般是由读书时的学籍档案和工作后的人事档案组成，如果没学籍档案就应该有工作的入职证明，合同和奖惩之类的记录。
农业户口和城镇户口的保险基本一样，只是险种和比例有些出入，但问题都不大的。住房公积金就没区别了
在学校里也有阿，我进厂时又给我办了一份档案。你自己也可以去办
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