在pcr反应过程中,要使用三个不同的温度变化,有变性,退火,扩增三个不同的反应阶段,而这三个反应需要的最适温度不同。具体设置如下:
1、变性反应温度的设置
当温度控制在90 °C以上时DNA会发生变性,双链DNA解链成单链。
2、退火反应温度的设置
当温度下降到50 °C的时候,DNA复性,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合。
3、扩增反应温度的设置
当温度上升到72 °C左右时延伸,DNA 聚合酶在此时有最大活性,能够催化4 种脱氧核苷酸合成新的DNA链。
扩展资料:
PCR温度与时间的设置:
基于PCR原理三步骤而设置变性-退火-延伸三个温度点。在标准反应中采用三温度点法,双链DNA在90~95℃变性,再迅速冷却至40~60℃,引物退火并结合到靶序列上,然后快速升温至70~75℃,在Taq DNA聚合酶的作用下,使引物链沿模板延伸。
对于较短靶基因(长度为100~300bp时)可采用二温度点法,除变性温度外、退火与延伸温度可合二为一,一般采用94℃变性,65℃左右退火与延伸(此温度Taq DNA酶仍有较高的催化活性)。
复性的温度 PCR 扩增是否顺利的关键因素,通常在50-60℃之间。具体的温度主要由引物的Tm值决定。延伸温度绝大多数设定为72℃ 。如果复性的温度很高,可以将延伸温度和复性温度设置成同一温度,变成二步法PCR 。
变性步骤一般使用 30 秒钟,如果模板的 G+C 含量较高,或直接用细胞做模板,变性时间可适当延长。复性时间有 30 秒种一般是足够的。延伸时间由扩增产物的大小决定,一般采用 1kb 用 1 分钟来保证充足的时间。
参考资料来源:百度百科-PCR反应循环参数
你的一对引物的TM值最好不要超过3℃,退火温度的一般比TM值低5℃,太低的退火温度会导致非特异性的扩增
反应参数可以设为:
94℃ 2 m
94℃ 30s }
50℃ 30s } 30cycles
72℃ 30s }
4℃ ∞
若是无目的条带,可将退火温度调低2°C