1952年,新中国仿照苏联的高等教育模式,对全国高等学校进行院系调整,综合性的浙江大学按照苏联模式被拆分成了多所单科性大学,部分系科并入省外兄弟院校,其中留在杭州的院系拆分成了四所大学——浙江大学、杭州大学、浙江农业大学、浙江医科大学(四校于1998年再次融为一体)。
浙江大学的师范学院的全部和文学院、理学院留在杭州的部分等成立浙江师范学院,1958年更名为杭州大学。
1995年,浙江大学成为首批7所列入国家“211工程”建设计划的全国重点大学之一。杭州大学、浙江农业大学、浙江医科大学也分别成为实力雄厚、特色鲜明,居于全国同类大学前列,在海外具有较大影响力的全国重点大学,并分别通过了“211工程”部门预审和重点建设项目立项论证。四所学校对浙江省乃至全国的经济建设和社会发展都作出了重要贡献。
1998年9月15日,鉴于苏联高等教育模式的弊端越来越明显,以及国家对建设中国特色世界一流大学的需要,经国务院批复,曾经从浙江大学分离出去的杭州大学、浙江农业大学、浙江医科大学回归浙大母体,共同组建了新的浙江大学。