内地居民因私往来香港或澳门特别行政区旅游、探亲、从事商务、培训、就业等非公务活动，向户口所在地的市、县公安出入境管理部门提出申请。凭公安出入境管理部门签发的往来港澳通行证及有效签注前往。
1、你的情况属于过境香港，可以不需要港澳通行证过境香港，并且可以在香港停留7天。 2、但是过海关的时候需要出示你从香港到马尼拉的机票，还有就是印度尼西亚的有效签证 如果这两样东西不齐全，海关会拒绝入境的。 如果都有的话，你就放心去吧~·
国内飞过去的话需要带香港签注的港澳通行证，希望对你有所帮助。
我已有港澳通行证，从三亚座飞机到香港
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