公司因为我没有及时交入职体检报告，和我自动解除劳动合同，会不会因为这样扣除我的工资？扣除工资合法吗

不会扣除工资，扣除工资是违法的。随意克扣工资可以向劳动行政部门投诉或者申请劳动仲裁要回工资。可以直接向劳动监察部门投诉克扣工资这种违法行为。劳动监察对违反劳动法规的单位或劳动者，可以依据现行劳动法律、法规、规章的决定，分别给予警告、通报批评、罚款、吊销许可证、责令停产整顿的处罚。
法律分析
克扣工资的解决办法：（一）向用人单位所在地的劳动监察部门投诉，举报人提供投诉人的姓名、性别、年龄、职业、工作单位、住所、联系方式和被投诉用人单位的名称、地址、电话、法定代表人或主要负责人的姓名、职务、电话等信息。如果不方便出面，可以选择拨打投诉电话：12333进行口头投诉，由举报中心接待员进行笔录，并由投诉人确认无误后签名或盖章，投诉人拒签的，应注明情况；如果接待员要对投诉过程录音，需要征得举报人的同意。（二）向用人单位所在地的劳动仲裁委申请劳动仲裁，仲裁申请书2份、申请人身份证复印件1份；相关证据复印件和证据清单2份以及用人单位的工商登记信息。提交材料后，5个工作日仲裁委会给予立案，再给双方举证期，给对方答辩期；然后开庭审理，之后对双方进行调解，调解不成仲裁委会下达裁决书；劳动仲裁60天内结案；对于裁决书不服，可以起诉到法院。
法律依据
《中华人民共和国劳动合同法》
第三十条 用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。
第八十五条 用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：（一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；（二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；（三）安排加班不支付加班费的；（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。

公司以这个理由把你辞退，是违法的，除非公司的内部规章制度明确规定了这一点。另外公司必须按月及时足额支付劳动者工资，即便辞退你，也要把工资全额支付完毕才可以的，不然可以带着相关证据，去企业所在地劳动监察大队进行投诉

不合法啊？你的身