应该是版本的问题，建议换个09版的试一下。我也遇到过这类的问题，用chemdraw画的，然后导入chem3d保存成.mol的格式，再用高斯view打开，高斯03输出的时候明明选择了.out的那个文件还是显示找不到指定文件。
