#!/usr/bin/perl -w
use strict;
my $filename="seq.txt";
my %id_GC_content; #id=>GC_content
open IN,$filename || die $!;
$/=">";
while (
my $id = $1 if(/^(\S+)/);# 获取序列ID
chomp; # 去掉末尾的”>”
s/^.+?\n//;# 删除第一行
s/\s//g; # 删除序列中的空白字符
my $GC = (tr/GC/GC/);#计算G或C碱基个数
my $AT = (tr/AT/AT/);#计算A或T碱基个数
my $len = $GC + $AT;# 计算序列非N长度
my $gc_cont = $len ? $GC / $len : 0; #计算GC含量,如果长度为0,GC含量算0
$id_GC_content{$id}=$gc_cont; #id=>GC_content
}
$/="\n";# 把输入记录分隔符改为默认值
close IN; # 关闭输入文件句柄
my @sort = sort{$id_GC_content{$b} <=> $id_GC_content{$a}} keys(%id_GC_content);
print $sort[0];