be动词出现在句中不一定是谓语动词。
主语+系动词+....这个句式中,系动词+...是谓语部分。如:Tom is in the garden.
Tom is eating an apple.这个句子中,is是助动词,和后面的eating一起构成谓语。is eating是句子谓语部分。eat是这个句子的谓语。
An apple is eaten by Tom every morning.这个句子里的is eaten是谓语部分,is是助动词,帮助谓语动词eat构成被动语态。
所以,要根据情况而定。