分子力学与量子力学区别如下：
1、基础理论不同
分子力学建立在经典力学理论基础上，借助经验和半经验参数计算分子结构和能量的方法，又称力场方法。
量子力学为物理学理论，是研究物质世界微观粒子运动规律的物理学分支，主要研究原子、分子、凝聚态物质，以及原子核和基本粒子的结构、性质的基础理论。
2、基本思想不同
分子力学的基本思想是将分子看作是一组靠弹性力维系在一起的原子的集合。
量子力学是描写原子和亚原子尺度的物理学理论。
3、应用不同
分子力学广泛地用于计算分子的构象和能量。
量子物理学的效应起了重要的作用。从激光、电子显微镜、原子钟到核磁共振的医学图像显示装置，都关键地依靠了量子力学的原理和效应。对半导体的研究导致了二极管和三极管的发明，最后为现代的电子工业铺平了道路。在核武器的发明过程中，量子力学的概念也起了一个关键的作用。
参考资料：百度百科-分子力学
参考资料：百度百科-量子力学
分子力学采用经典牛顿力学模型，因此只能描述核运动， 不能反映电子运动。
而量子力学采用量子力学的方法，可用用波函数描述体系的电子运动状态。
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