经脱粒净种后的种子要进一步干燥,应干燥到种子的标准含水量,即这时种子内的含水量仅能维持其生命活动必需的最低限度,如果高于此含水量,种子的新陈代谢作用旺盛,不利于长期保存种子的生命力,低于此含水量即引起对种子的伤害。大多数种子的标准含水量和它充分气干时的含水量大致相等。如杜仲为13%~14%,皂荚为5%~6%。
干燥方法,最常用的是晒干,大部分喜阳的,生长在开阔地带的药用植物都采用晒干的方法,如黄芪、党参、甘草、连翘、长春花、仙鹤草、地耳草、茵陈、毛地黄、侧柏、曼陀罗、鸡冠花、国槐、地榆、苍术、苦参、紫草、川楝、云实、云木香、白术、百部、香薷、夏枯草、篇蓄、瞿麦、千日红、白花菜、桔梗等。
而一些来源于高海拔地区的或喜阴中药植物,或种子内含油或芳香油较高的种类,则适宜阴干。如大黄、当归、黄柏、龙胆、荆芥、知母、白芷、黄芩、羌活、龙葵、白屈菜、蒲公英、白花前胡、商陆、刺五加、千里光、桑、秦艽、金盏花、枸杞等种子。
另有一些中药植物种子不耐干燥,干后丧失发芽率,如细辛、重楼、枳壳、七叶树、罗汉松、红毛七及很多原产热带或亚热带中药植物则适宜随采随播,或采后清洗出种子,随即用湿沙贮藏。适宜随采随播或沙藏的种类还有:升麻、天葵、掌叶半夏、独活、酸枣、三颗针、乌桕、八角枫、阔叶十大功劳、鸡屎藤、天南星、芫花、银杏、忍冬、吴茱萸、明党参、贝母、牡丹、杜仲、厚朴、五味子、人参、延胡索、天门冬、使君子、血盆草、败酱、南天竹、女贞、射干、木瓜、芍药、黄连及其他很多热带药用植物。