B-DNA是与细胞中DNA结构最接近的，B-DNA是一种理想结构，不能预示基因活动，与细胞中的DNA略有不同，体现在两个方面：第一，溶液中的DNA分子比B-DNA分子的螺旋程度更高，平均每螺周有10.5个碱基对；第二，B型DNA构象是均一的结构，然而实际的DNA没有如此规则，甚至从精细结构看，它的各个碱基对之间都有所不同。
